Les entrailles de la planète abritent un tout nouveau monde qu’Olimar et Louie vont pouvoir explorer. Dans votre chasse aux trésors quotidienne, il vous arrivera de tomber sur des trous creusés dans le sol, vous conduisant à des galeries souterraines inédites et fascinantes aux multiples défis.

Avant de partir explorer ces grottes qui s’étalent sur plusieurs niveaux, il vous sera donné un aperçu de ce qui vous attend. Ainsi pourrez-vous tenir compte des dangers prévisibles pour organiser votre équipe d’exploration composée de Pikmin.

Quelle que soit la forme que prendra votre équipe, il ne vous restera plus qu’à espérer qu’elle sera à la hauteur de la mission. Parce qu’une fois dans la grotte, vous ne pourrez plus accéder aux Oignons générateurs de Pikmin dont vous vous servez lorsque vous êtes à la surface...

Mais si l’entreprise semble périlleuse, elle en vaut la chandelle. Les grottes regorgent bien souvent de trésors, qu’il s’agisse des Fleurs Cracheuses nécessaires pour créer les Pikmin violets et blancs ou des boss qui, terrés dans les souterrains, produisent des objets spéciaux dont Olimar et Louie peuvent se servir pour élargir leurs compétences.